Bonjour Sabine et bienvenue sur le forum,
Je ne réponds pas par pitié mais tout simplement pour essayer de venir en aide et par ailleurs comment rester indifférent à une reconnaissance éternelle.
Pour résumer, je comprends que tu possèdes Ancestrologie à la version 2.1.0.0 avec une version de base qui devrait être b3.00. Tu possèdes par ailleurs une clé d'activation Ancestrologie. Selon les archives cette clé est apparue avec la version Ancestrologie v4.2.2.10 associée à une base b3.17.
La clé ne semblait par conséquent pas indispensable pour faire fonctionner Ancestrologie 2.1.0.0. Ce n'est pas très important pour la suite mais ce serait intéressant de vérifier de ton côté les versions application et base. A l'évidence ta conclusion était la bonne, dans un cas comme dans l'autre il n'est pas possible d'utiliser l'outil de migration pour effectuer une mise à jour du logiciel.
Le passage vers une version récente imposera la mise en place de la clé d'activation pour échapper aux panneaux d'attente de 45 secondes au démarrage comme à l'arrêt du logiciel.

Clé d'activation Ancestrologie
Si tu détiens une clé d'activation Ancestrologie, il n'est pas nécessaire de procéder à l'acquisition d'une clé plus récente. A l'aide de tes identifiants: n° de commande et adresse email de commande, tu peux effectuer une demande de clé qui te sera délivrée par messagerie. Si ton adresse email de commande n'est plus valable, il faudra procéder d'une autre façon pour que la clé ait une chance de te parvenir.
Pour effectuer la demande de clé, tu peux aller sur le site Ancestrologie et utiliser le volet Activation.
http://www.ancestrologie.org/site/index.php?option=com_wrapper&view=wrapper&Itemid=4 
Mise à jour - Installation
En raison de la vétusté du logiciel en place, je suis convaincu qu'il est préférable de passer par une nouvelle installation à l'aide du module d'installation complète téléchargeable librement depuis le site. Avant de procéder à cette installation, il conviendra de sauvegarder tes données. Celles-ci sont contenues dans la base de données qui par défaut porte le nom Ancestrologie.bdd et se trouve à l'emplacement C:\Program Files\Ancestrologie\Database. Dans le répertoire \Database tu devrais trouver le fichier en question. Tu disposes éventuellement d'autres données sous la forme de médias, de documents, etc... Il convient de faire les sauvegardes correspondantes. En définitive, il faut passer en revue le contenu du répertoire C:\Program Files\Ancestrologie.
Ces précautions étant prises et pourquoi pas en ajoutant un export gedcom, tu pourras désinstaller Ancestrologie à l'aide de l'utilitaire Windows: Ajout / Suppression de programmes.
Il sera alors possible de procéder à l'installation d'Ancestrologie, de mettre la nouvelle clé d'activation en place puis de vérifier le bon fonctionnement d'Ancestrologie avec la base mise en place lors de l'installation. Cette dernière contient quelques éléments de la généalogie Napoléon.
Dans l'immédiat, le mieux est d'en rester à ce stade, lorsque la nouvelle installation sera opérationnelle, nous traiterons de la récupération des données.
S'il y a des points qui restent obscurs, il ne faut pas hésiter à en parler.